Сюжет Lost Sphear расскажет о мальчике, который в один прекрасный день обнаруживает, что его родной город исчез. Теперь чтобы спасти весь остальной мир от подобной участи, герою вместе с друзьями предстоит перестроить мир вокруг себя с помощью силы Памяти. Игроков ждет некоторые обновленные функции, в том числе и улучшенная боевая система.